Село Алферьево в прошлом относилось к Владимирской губернии, ныне оно находится в составе Ярославской области.
В этом селе с древних времен существовала деревянная Никольская церковь, первое упоминание о которой относится к 1628 году. В начале XVIII века она была возведена заново, тоже из дерева, а в 1772 году в селе была построена еще одна деревянная церковь – Покровская.
В 1814 году вместо двух деревянных церквей был сооружен существующий ныне каменный храм в честь Покрова Пресвятой Богородицы. В теплой трапезной, устроенной при нем, разместились два придела. Первый – в память о прежнем храме – святителя Николая Чудотворца, второй – святителя Димитрия Ростовского. В то время священником церкви являлся Иван Васильевич Фруктов.
Покровская церковь относится к стилю классицизм, ее фасады декорированы колоннами и фронтонами, четверик увенчан огромным куполом.
Церковь была закрыта в 1941 году, занята складом. Возвращена верующим в 2000-х годах, ремонтируется, опекается причтом Покровской церкви города Переславля.